گاها نوع سرطان های کیستیک کلیه دیده می شود که در مقایسه با کیست ساده تفاوت های ساختاری واضحی دارند که به راحتی در سونوگرافی ( با در نظر گرفتن یافته هایی نظیر ضخامت جدار کیست، کلسیفیکاسیون و نامشخص بودن مرز کیست و موارد دیگر ) و سی تی اسکن قابل افتراق هستند. سی تی اسکن دقیق ترین روش برای تمایز بین کیست ساده و سرطان کلیه است. سونوگرافی در بسیاری از موارد می تواند کیست کلیه را از توده توپر افتراق دهد. توصیه می شود که برای پیگیری کیست ساده، سالانه سونوگرافی انجام شود. اگر تغییرات مشاهده شده، سرطان کلیه را مطرح کند، باید سی تی اسکن انجام شود. وجود خون در ادرار و درد کلیه شایع‌ترین علائم هستند. در صورت عفونت، کلیه‌ها دردناک و همراه با تب و لرز است. نارسایی کلیه که با سردرد، تهوع، استفراغ، ضعف و کاهش وزن بروز می‌کند نیز وجود دارد. گاهی بیمار متوجه یک توده شکمی می‌شود. در ۶۰ تا ۷۰ درصد از بیماران افزایش فشارخون وجود دارد. کیست کلیه می تواند اندازه متغیر داشته باشد که از کمتر از نیم سانتیمتر تا بیشتر از ۲۰ سانتیمتر متغیر است .